飯高檀林於1580年(天正8年)開設,以江戶時代為主曾經繁榮一時,是日蓮宗最古、最大、最高的學府,據說鼎盛期曾有600~800名的學僧學習。雖然進入明治時代以後由於實行“學制改革”而變為廢檀,但講堂、鐘樓、鼓樓、總門依然按往昔的原樣保存著,被指定為國家的重要文物。